通常情況下，拉肚子指腹瀉。三個月寶寶腹瀉有奶瓣可能是食物中含有脂肪、乳糖的量較多、消化不良等因素引起的。具體分析如下：
三個月的寶寶可能是母乳喂養或者喝奶粉。如果母親食用較多高脂肪、高蛋白、高乳糖的食物，容易導致母乳中也含有較多脂肪、乳糖等，或者寶寶食用的奶粉中含有較多乳糖，而三個月的寶寶消化系統發育還不完善，無法將這些元素完全消化，所以會出現腹瀉、有奶瓣的情況。這種情況下，母親減少食用高蛋白、高乳糖的食物或者使用含有乳糖量較少的奶粉喂養寶寶，就可以緩解這種情況。
如果寶寶腹部受涼或者胃腸感染，就容易出現消化不良的情況，可能會出現腹痛、腹瀉、嘔吐、反胃等癥狀，所以三個月的寶寶腹瀉、有奶瓣與消化不良有關，因為消化不良就無法將食物中的營養成分如蛋白、乳糖、脂肪等完全消化，所以會出現大便有奶瓣的情況。建議家長遵醫囑給寶寶服用小兒化食丸、醒脾養兒顆粒、嬰兒健脾顆粒等藥物進行治療。