十二指腸潰瘍的疼痛一般出現于右上腹部，具體部位為劍突下以及兩肋弓的交界處。十二指腸潰瘍所引起的疼痛具有周期性、持續性等特征，并且可表現為多種形式，如鈍痛、脹痛、灼痛等。尤其在饑餓或睡眠狀態時，疼痛會越發明顯，這是由于該時期胃內容物相對缺乏的情況下，胃酸、膽汁、消化酶等物質濃度升高，會加劇對潰瘍組織的刺激。
另外，十二指腸潰瘍出現的疼痛也受交感神經叢放射性作用的影響，因為十二指腸潰瘍患者病發時產生的疼痛，會牽涉至整個上腹區域或身體其他部位，尤其是中腹、胸腔、背部等。部分患者進行咳嗽、打噴嚏、深呼吸等動作時，會導致疼痛加劇。
十二指腸潰瘍通常與幽門螺桿菌感染存在密切聯系，常發生于青壯年男性群體，所以臨床上，可以遵醫囑采取四聯療法進行抗幽門螺桿菌治療，常用藥物包括克拉霉素、阿莫西林、奧美拉唑、枸櫞酸鉍鉀等。治療期間，患者應戒除煙、酒，避免食用辛辣、生冷的食物，以免刺激患處，導致病情加重。