肛門瘙癢不一定是性疾病，可能與肛門瘙癢癥、肛門濕疹等疾病有關，也可能與肛門尖銳濕疣等性疾病有關，需要根據患者自身病因給予針對性治療，一般可用過地塞米松軟膏、丁酸氫化可的松軟膏、咪喹莫特乳膏等藥物進行治療，具體如下：
1、肛門瘙癢癥：肛門周圍皮膚無任何原發皮膚損害，僅有瘙癢癥狀的一種皮膚病。臨床癥狀主要表現為肛周皮膚陣發性瘙癢、刺痛、灼痛等，患者可使用硫磺軟膏、地塞米松軟膏等藥物進行治療。
2、肛門濕疹：肛腸科常見的一種過敏性非傳染性皮膚病。其病變多局限于肛門口及肛周皮膚，也可延及會陰部以及外生殖器等部位。臨床癥狀主要表現為瘙癢、疼痛、肛門潮濕、肛周皮膚破潰、消化不良、腹脹、便秘、腹瀉等，患者可使用紅霉素軟膏、丁酸氫化可的松軟膏等藥物治療。
3、肛門尖銳濕疣：感染人類乳頭瘤病毒引起的增生性疣狀贅生物。臨床癥狀主要表現為肛門邊緣及外陰部可見菜花狀、雞冠狀或巨大團塊疣、瘙癢等，可通過性接觸傳播，患者可使用維A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等藥物進行治療，也可用激光、冷凍去除疣體。