三個月嬰兒腦袋發熱可能是正?，F象、反復摩擦、環境溫度過高、普通感冒、扁桃體炎等原因引起的，需要積極進行對癥治療。
1、正?，F象：嬰兒的血液循環速度比較快，大腦的血液循環更快，腦袋的溫度會比身體的溫度高，屬于正常的現象，一般不需要特殊治療。
2、反復摩擦：如果嬰兒經常在枕頭上打滾，就可能會導致腦袋被反復摩擦，引起腦袋發熱的癥狀，一般不需要特殊治療，讓嬰兒多休息即可。
3、環境溫度過高：如果嬰兒所處的環境溫度比較高，就可能會導致腦袋溫度升高，一般不需要特殊治療，家長及時改善嬰兒所處的環境即可。
4、普通感冒：該疾病可能會刺激免疫系統，刺激炎癥因子釋出，可能會出現發熱、咳嗽等癥狀，建議家長遵醫囑給嬰兒服用小兒氨酚黃那敏片、小兒清感靈片等抗感冒的藥物進行治療。
5、扁桃體炎：該疾病可能會引起扁桃體炎癥，可能會出現咽喉腫痛、腦袋發熱等癥狀，建議家長遵醫囑給嬰兒服用頭孢克肟顆粒、阿莫西林顆粒等消炎的藥物進行治療。
在治療期間家長需要注意保持嬰兒腦袋周圍的清潔和衛生，給嬰兒多喝水，有利于身體的恢復。