長期龜頭炎，可能誘發生殖系統炎癥、泌尿系統炎癥、性功能障礙、尿道狹窄等并發癥，將會降低生活質量。因此，出現龜頭炎后，應及時進行治療，避免龜頭炎反復發作，引起嚴重后果。
1、生殖系統炎癥：長期龜頭炎可能會反復誘發部分生殖系統炎癥，例如前列腺炎、附睪炎、精囊炎等，治療不及時，病變持續加重，還可能會影響到精子質量與數量，甚至會導致男性不育；
2、泌尿系統炎癥：由于龜頭部位長時間存在炎性物質，可能會侵及尿道，進入尿道或者膀胱內，引起尿道炎或者膀胱炎，感染也可能會上行，引起腎盂腎炎，可導致患者出現尿頻、尿急、尿痛等癥狀，會對日常的生活和工作造成不良影響；
3、性功能障礙：龜頭部位長時間受到炎性物質刺激，可能會導致龜頭敏感，還可能會導致龜頭部位的神經受損，誘發性功能障礙等疾病，比如早泄或者是陽痿，可能會降低性生活質量；
4、尿道狹窄：長期龜頭炎可能會導致龜頭開口部位出現瘢痕增生組織，容易堵塞尿道，形成尿道狹窄，導致排尿困難。