只要藥物流產徹底并且得到適當的護理，通常不會對下一次的懷孕產生不良影響。然而，如果藥物流不徹底導致宮內感染，從而引發內膜的損傷和粘連，這可能會增加不孕的風險，需要及時就醫進行治療。
藥物引起的損傷相對較小，通常不會對內膜組織造成直接損害，因此成功率相當高。因此，在藥物流產完全排出的過程中，需要加強護理措施，確保有足夠的營養來增強身體素質，并有助于身體的快速恢復，通常不會對下一次的懷孕產生不良影響。
然而，當藥物流不徹底，如內膜未能完全剝離或孕囊未能完全排出時，孕囊和其他組織的異物可能會長時間滯留在宮內，這可能導致子宮和陰道發生炎癥感染，進而引發輸卵管、子宮和盆腔的粘連，最終可能導致不孕問題。因此，對于藥物流產后出現繼發性不孕癥要及時進行治療處理。再者，當藥物流出時，女性的身體會變得非常虛弱，其免疫和抵抗能力都會顯著減弱。如果此時不重視外陰部的護理，可能導致營養不足、寒冷引發的炎癥、宮寒、月經不規律等問題，這些都可能對受精或著床的過程產生不良影響，進而影響到下一次的懷孕計劃。