支原體二次感染時需要完善相關檢查，明確感染情況，同時在醫生指導下使用藥物進行抗感染治療。此外還需要針對支原體感染導致的癥狀進行治療，進行生活干預，積極配合治療，預防復發。
1、完善檢查：支原體二次感染的患者需要及時前往醫院就診，完善血常規、病原學等檢查，懷疑有尿路感染或者支原體肺炎的患者需要完善CT、B超等檢查，明確病情；
2、抗感染治療：支原體二次感染時需要使用抗生素藥物針對支原體感染進行治療，常用的抗生素藥物是大環內酯類抗生素，如阿奇霉素分散片、羅紅霉素分散片等。由于支原體感染治療的療程通常較長，患者需在醫生指導下嚴格按照療程用藥治療，不可擅自停藥，避免復發；
3、對癥治療：支原體經呼吸道感染時會伴有發熱、咳嗽、胸悶等癥狀，此時可以使用對乙酰氨基酚片等進行治療，如果導致支原體肺炎出現咳嗽、咳痰癥狀，需要遵醫囑使用止咳化痰藥物，如氫溴酸右美沙芬片、鹽酸氨溴索口服溶液等進行治療；
4、生活干預：支原體反復感染可能是因為患者的免疫力低下，因此患者需要注意清淡飲食，補充營養，注意營養均衡，同時需要適當鍛煉，養成良好的生活習慣，增強免疫力。與此同時，需要注意衛生，室內要多通風、做好消毒，出門要戴好口罩，預防支原體經呼吸道感染。針對支原體導致的尿路感染的預防，需要注意內衣、內褲等私密用品的清潔，避免不潔性行為。