亞甲亢臨床癥狀較輕，甚至無明顯臨床癥狀，但甲亢發病時可見突眼、心悸、心動過速、失眠、情緒易激動，甚至焦慮等癥狀。嚴重時還會導致甲亢性心臟病，且亞甲亢和甲亢患者抽血后，檢查結果顯示亞甲亢患者的甲狀腺功能優于甲亢患者，因此患甲亢時情況相對嚴重。
亞甲亢可見于甲亢早期或甲亢治療過程中，甲狀腺功能向好轉方向發展時，也可表現為亞甲亢。早期亞甲亢治療藥物劑量通常偏小，而機體患甲亢時，可見明顯甲狀腺異常狀態，通常需足量使用甲巰咪唑等甲亢藥物治療，若在甲亢治療過程中逐漸變為亞甲亢，一般提示治療有效，此時需將甲亢藥物適當減量，以免發生藥物性甲減。
雖然亞甲亢和甲亢均需采取藥物治療，但部分特殊人群無需治療，如處于妊娠早期階段的產婦，可能因激素原因導致亞甲亢。此時一般不建議采用藥物治療，適當注意休息，分娩結束時亞甲亢癥狀可逐漸消失，以及進行甲狀腺切除的甲狀腺癌患者，因口服補充較多甲狀腺素鈉以防止甲狀腺癌復發，可能導致患者處于亞甲亢狀態，因此也無需特殊治療。