奧硝唑陰道栓主要用于治療細菌性陰道病、滴蟲性陰道炎等陰道炎癥，通常是陰道用藥，患者應在醫生的指導下用藥。
患者應在睡前使用奧硝唑陰道栓，這是因為夜晚人體活動減少，有利于藥物在陰道內停留較長時間，充分發揮藥效。奧硝唑陰道栓按照醫囑陰道用藥，此藥在體溫下能逐漸融化，藥物成分會釋放出來，直接作用于陰道黏膜及病變部位，抑制或殺滅病原體。栓劑的設計形狀適合陰道的生理結構，能較好地貼合陰道壁，保證藥物均勻分布。
如果使用奧硝唑陰道栓，患者需要注意在用藥期間避免性生活，防止影響藥物療效以及引起交叉感染。患者需要保持外陰清潔，可每天用溫水清洗外陰，但不要沖洗陰道，避免破壞陰道內的正常菌群平衡。