菊花具有清熱解毒、平肝明目的功效，常用于泡茶飲用以調理身體，菊花泡了一夜后，營養成分可能已經有所流失，且長時間浸泡可能導致細菌滋生，所以不建議繼續飲用。
從藥性變化的角度來看，菊花茶在長時間的浸泡過程中，藥性可能逐漸減弱。中醫講究藥食同源，而藥材的有效成分在適宜的時間內才能充分釋放并被人體吸收。菊花茶泡制時間過久，不僅藥效減弱，還可能因長時間暴露在空氣中而發生氧化反應，影響其原有的藥用價值。
從衛生安全的角度考慮，菊花茶在泡制后若未能及時飲用，容易成為細菌滋生的溫床。中醫強調食飲有節，即飲食要有節制和規律，避免食入不潔之物。長時間浸泡的菊花茶，尤其是在溫暖潮濕的環境中，更容易滋生細菌，這些細菌可能對人體健康造成潛在威脅，如引起腹瀉、腹痛等不適癥狀。
從中醫養生的角度來看，菊花茶雖好，但并非所有時間都適宜飲用。在夜間人體陽氣逐漸收斂，陰氣漸盛，此時飲用寒涼性質的菊花茶可能不利于陽氣的收藏和身體的休息。即使菊花茶在夜間泡制后未變質，也不建議繼續飲用。
為保證菊花茶的最佳功效與安全性，應避免長時間浸泡，尤其是過夜飲用。正確的方式是適時泡制，及時享用，以充分汲取其藥性與營養，同時維護身體健康。