肩關節核磁共振的費用，要根據醫院的收費標準進行分析。不同醫院之間收費的標準會有一定的區別，不能一概而論，費用一般在700-800元。通過肩關節核磁共振檢查，可以明確肩關節周圍是否存在肌肉軟組織方面的損傷。
1、三級醫院：由于醫院的等級比較高，相對而言費用也較高。在三級醫院通過磁共振檢查肩關節的病變，一般收費標準在800元左右；
2、二級醫院：部分二級醫院也可以做核磁共振檢查，做肩關節核磁共振檢查時，通常需要700多元的費用，相對較三級醫院低，與醫院等級偏低有關。
進行肩關節核磁共振檢查時，要注意去掉身體上所有的金屬物質，因為檢查過程當中存在一定的磁場，如果有金屬物質，容易產生不良后果，甚至影響檢查的結果。當檢查發現異常病變時，需要盡早針對性治療，防止后期產生肩關節活動受限等運動功能障礙后遺癥。