灸一般指艾灸，命門是經常用于艾灸的穴位，其位于督脈，艾灸命門具有改善腎部功能、腸胃功能，以及腰痛、女性痛經、婦科疾病等作用，但是艾灸命門的時間不能過長，否則容易導致上火、氣血兩虛等情況。
1、上火：艾灸命門可以補充陽氣，但是如果艾灸時間太長，容易引起上火；
2、氣血兩虛：假如火力過猛，容易引起氣血兩虛，因此在艾灸命門時，可以艾灸的頻率高一些，但艾灸的時間短一些，每次艾灸10分鐘左右即可；
3、陰虛津傷：艾灸命門具有補養作用，長時間艾灸命門容易煽動身體內熱，導致身體出現陰虛津傷等情況；
4、精氣耗損：命門位于兩腎盂之間，艾灸需要虛脫部分精氣，時間過長會對人體精氣造成耗損。
經常艾灸的穴位有關元穴或神闕穴，其艾灸的時長相對命門要稍長，所以命門不能艾灸太長時間也是相對而言，對于神闕穴和關元穴，命門艾灸的不能過長，而命門艾灸的時間實際上比大椎穴、百會穴艾灸的時間稍長。艾灸后一定要注意保暖、避免著涼，建議在艾灸后半小時左右多喝紅糖姜水，有助于促進身體新陳代謝。