高密度脂蛋白膽固醇0.99mmol/L是不太正常的，該數值低于正常值。
高密度脂蛋白膽固醇正常值應為男性在1.16mmol/L-1.42mmol/L之間，女性在1.29mmol/L-1.55mmol/L之間。高密度脂蛋白膽固醇0.99mmol/L，明顯低于正常值水平，無論是男性患者還是女性患者，都是不太正常的。高密度脂蛋白膽固醇偏低考慮是糖尿病、動脈粥樣硬化、急性感染等原因引起。
糖尿病屬于代謝類疾病，主要是患者胰島素分泌不足或利用不足造成的，患者糖類代謝紊亂，也有可能會影響脂肪代謝，導致患者高密度脂蛋白膽固醇降低。高密度脂蛋白膽固醇還可能因身體脂質代謝異常，導致動脈粥樣硬化。動脈粥樣硬化和高密度脂蛋白膽固醇降低存在相互作用、相互影響的關系。如果患者出現急性感染，如急性腸胃炎、腦膜炎、肺炎等疾病，這種情況通常為一過性高密度脂蛋白膽固醇降低，可在感染控制后逐漸恢復正常。
高密度脂蛋白膽固醇偏低的情況，還可能是由于用藥不當、腎病綜合征等。建議患者及時就醫，完善相關檢查，在醫生指導下進行針對性治療，以免導致病情加重。