16歲月經兩三個月沒來可能與卵巢功能的不完善、內分泌失調、貧血、多囊卵巢綜合征、高催乳素血癥等因素有關，建議及時就診，明確情況后遵醫囑進行干預。
1、卵巢功能的不完善：16歲的女孩的卵巢功能可能還未完全成熟，因此無法產生正常水平的雌激素，也無法保持子宮內膜的周期性脫落，可能導致月經不規律。這通常是正常的，隨著身體發育，月經通常會逐漸產生規律，一般不用特別處理。
2、內分泌失調：主要是由于生活的不規律和巨大的精神壓力等原因導致的，由于體內激素水平的紊亂，可能引起月經不規律。為了改善該狀況，可以調整生活方式、放松心情。
3、貧血：主要是由于紅細胞被過度破壞或其生成不足所導致的，通常會使人體的外周血中紅細胞的數量減少，無法為各種組織和器官提供充足的氧氣，可能干擾雌激素的正常分泌，導致月經不規律。在醫生的建議和指導下，可以使用硫酸亞鐵片、琥珀酸亞鐵片和葉酸片等藥物進行治療，有助于刺激紅細胞的生成。
4、多囊卵巢綜合征：可能是由遺傳和環境因素共同作用導致的，會干擾卵巢的正常功能，導致身體無法產生正常水平的雌激素、孕激素，出現月經異常、痤瘡等癥狀，需要按照醫生的建議使用黃體酮膠囊、戊酸雌二醇片、尼爾雌醇片等藥物進行治療。
5、高催乳素血癥：可能是由于下丘腦問題、垂體問題、原發性甲狀腺功能下降等因素導致的血清催乳素水平異常升高，可能影響生殖、內分泌和神經系統，臨床表現通常包括月經不規律、頭痛、肥胖等。在醫生的指導下，可以使用甲磺酸溴隱亭片和維生素B6片等多種藥物進行治療。
在干預過程中，切忌盲目采用偏方，以免對身體產生明顯的負面影響。