兩種毒株通常會交叉感染。
交叉感染是天然宿主的病原體感染或傳遞給非天然宿主的現象，通常指由相互影響、相互傳遞的細菌、病毒、真菌、寄生蟲等病原體侵入人體后所引起的病理現象。
面對兩種毒株，通常存在交叉感染的風險。以新型冠狀病毒為例，隨著新型冠狀病毒的不斷變異，目前已經出現多種關切變異株，包括德爾塔、伽馬、奧密克戎等變異株，而這些變異株也有多種亞型的毒株，比如奧密克戎可以進一步劃分為BA.5.2、BF.7、BQ.1、BQ.1.1等亞型。如果患者曾感染某一種亞型的毒株，體內通常能夠形成對應亞型的抗體，在一定時間內有助于抵抗該亞型毒株的再次侵襲。但是，并非所有患者均會感染同一種毒株，并且這種抗體對于其他亞型的毒株通常沒有明顯的抵抗能力，使得不同亞型的毒株有機會通過呼吸道飛沫傳播、密切接觸傳播、氣溶膠傳播等方式廣泛傳播，進而發生交叉感染。
因此，為預防交叉感染，平時要注意做好防護，外出時要正確佩戴口罩，盡量避免去人員密集的或通風較差的場所，以盡可能地降低交叉感染的風險。