通常來說，吃了緊急避孕藥兩周后有褐色分泌物可能是正?，F象，也可能與藥物副作用、宮頸炎等原因有關，建議患者按醫囑對癥治療。具體分析如下：
1.正?，F象：如果患者最近月經即將來潮，可能會在月經來之前出現褐色分泌物，這是一種正?，F象，與吃了緊急避孕藥無關，建議患者最近注意飲食，避免生冷辛辣的食物即可。
2.藥物副作用：部分患者吃了緊急避孕藥之后，可能會出現陰道少量出血、頭暈、惡心、嘔吐、異常分泌物等藥物副作用，所以吃了緊急避孕藥兩周后有褐色分泌物可能是藥物副作用導致的。建議患者注意觀察，如果這種情況持續時間較短，并且無其他不適，一般無需治療。
3.宮頸炎：如果本身存在宮頸炎，可能會出現有褐色分泌物的情況，與吃了緊急避孕藥無關，同時患者會出現小腹部疼痛、分泌物增多等癥狀，建議在醫生的指導下使用藥物治療，常用藥物有阿司匹林片、阿奇霉素片、青霉素V鉀片等。