小劑量的水合氯醛灌腸劑不會對寶寶造成副作用，大劑量使用時可能會有副作用，比如胃腸道反應、肝腎損傷、呼吸困難等。
1.胃腸道反應：
水合氯醛灌腸劑具有一定的刺激性，灌腸后可能會刺激胃腸道黏膜，引起嬰兒惡心、嘔吐、腹瀉、腹痛等不良反應。
2.肝腎損傷：
由于水合氯醛灌腸劑主要經肝臟和腎臟代謝，如果大劑量應用會損傷肝臟和腎臟，引起肝功能不全和腎功能不全，寶寶可出現黃疸、食欲降低、尿少等癥狀。
3.呼吸困難：
大劑量使用，可抑制心肌收縮力，使心臟搏動無力，并且可以抑制延髓呼吸中樞，出現呼吸困難。
除以上相對副作用外，還可能會引起寶寶嗜睡、精神錯亂、皮膚過敏等副作用。注意肝、腎、心臟功能嚴重障礙、過敏患者禁用水合氯醛灌腸劑。
建議患者及時就醫，應在醫生的指導下合理用藥，不可自行盲目用藥，以免造成不良反應。