銀杏葉提取物可能導致的不良反應包括感到乏力、舌頭干燥和腹部膨脹。為了安全起見，應在治療期間禁止服用其他藥物或使用其他有可能導致過敏等不良反應的藥品。對于出現過敏反應的人、新生兒，這是禁止使用的，需要及時就醫進行治療。
銀杏葉提取物可能導致的不良反應包括乏力、口干、舌燥、胸悶和腹脹等癥狀，另外銀杏葉的提取成分可能導致心跳加速、胸部不適、短暫的血壓上升等副作用，并可能引發呼吸急促，另外還可能會使患者發生惡心、嘔吐、腹瀉、便秘以及尿急等現象。在某些情況下，可能會出現寒戰、發熱、身體疼痛和出汗過多等不適癥狀。若對銀杏葉提取物產生過敏反應，可能會導致咽喉部位出現水腫、瘙癢、水腫、皮疹、呼吸不暢和血壓降低等副作用。
對于對銀杏葉提取物有過敏反應或出現過敏癥狀的人，以及新生兒，禁止使用銀杏葉提取物。銀杏葉提取物中富含大量的銀杏酸，而銀杏酸對人體具有毒性，因此長期食用銀杏葉提取物是不建議的。