新生兒呼吸不規則的原因包括喉軟骨發育不全、呼吸中樞系統發育不全、上呼吸道感染等原因。
1、喉軟骨發育不全：新生兒的喉軟骨發育尚不完善，常會引起呼吸不規律，呼吸時有聲音出現的情況，屬于較為常見的現象，一般不做特殊治療。
2、呼吸中樞系統發育不全：該情況多見于早產兒，因為呼吸中樞系統發育不健全，所以常出現呼吸節律不規則，表現為呼吸深淺交替、快慢不均等情況。建議再觀察一段時間，如果是早產兒，建議放進保溫箱中，避免引起不良反應。
3、上呼吸道感染：如果沒有注意身體保暖，可能會引起上呼吸道感染，導致咽喉黏膜水腫，出現咳嗽、呼吸不規律等情況。建議適當喂水緩解，也可以遵醫囑使用小兒止咳糖漿、小兒黃龍顆粒等藥物治療，起到清肺止咳的作用。
除上述常見原因之外，還可能是咽炎、支氣管炎、肺炎等因素導致的，建議及時就醫治療。