痘印一般指痤瘡印。莫匹羅星軟膏通常不可以消除痤瘡印。
莫匹羅星軟膏為局部外用抗生素，適用于革蘭氏陽性球菌引起的皮膚感染，對各種革蘭氏陽性球菌有很強的抗菌活性，對耐藥的金黃色葡萄球菌也有效。適用于膿皰病、癤、毛囊炎等原發性皮膚感染以及濕疹合并感染、潰瘍合并感染、創傷合并感染等繼發性皮膚感染。使用該藥物一般可以用于預防痤瘡感染，但是通常不能起到消除痤瘡印的作用。
痤瘡印是痤瘡處理不當，或痤瘡損傷皮膚后形成的瘢痕或色素沉著，可分為血液型紅色痤瘡印、色素性黑褐色痤瘡印以及瘢痕型痤瘡印，因為莫匹羅星軟膏的作用主要是抗菌，無法抑制增生和色素沉著，所以通常不能用于消除痤瘡印。
消除痤瘡印可遵醫囑使用表皮更新類外用藥物，如維A酸乳膏、阿達帕林凝膠等，可促進表皮細胞的新陳代謝，從而有效減少痤瘡印色素沉積，具體的效果存在個體差異。
莫匹羅星軟膏常見的不良反應為局部燒灼感，偶見瘙癢、紅斑或干燥等，一般不需要停藥。如果出現嚴重的皮膚刺激，需停止使用，擦凈軟膏并盡快去醫院就診。