大腸桿菌噬菌體是一種病毒，寄生于大腸桿菌，而大腸桿菌可導致人體發生感染性疾病，因此若合理利用大腸桿菌噬菌體，可用于治療大腸桿菌感染性疾病，對人體有好處，但若濫用，則可能對人體有壞處。
1、好處：噬菌體主要寄生于細菌中，對于人體沒有直接損害，但由于大腸桿菌噬菌體寄生于大腸桿菌后可造成大腸桿菌裂解，因此可以抑制大腸桿菌在人體的增殖，對于大腸桿菌所致的腹瀉，可以起到改善的作用；
2、壞處：由于大腸桿菌在人體內，也可促進消化道食物分解，還可抑制其他致病菌增殖，另外對于機體中維生素K的合成也有一定作用。若盲目使用大腸桿菌噬菌體，可能導致腸道本身的菌群被破壞，造成腸道菌群失調，使患者出現消化不良等不適癥狀，因此盲目使用對人體有壞處。
目前大腸桿菌噬菌體的應用正在研究中，自然界中大量噬菌體的存在為抗菌治療也提供了一定思路。但由于尚無研究成熟的產物，因此目前若患者出現大腸桿菌感染時，應當盡快前往醫院就診，在醫生指導下使用抗菌藥物治療。