一般來說，連續三年體檢發現甲胎蛋白升高可能是肝硬化、肝癌等疾病引起的，可通過藥物治療、手術治療、一般治療等方式進行治療。具體內容如下：
1.肝硬化：病毒感染、酒精刺激等因素可引起肝硬化，出現連續三年體檢發現甲胎蛋白升高的情況，還伴有腹部不適、乏力、食欲減退等癥狀。建議患者遵醫囑使用低分子肝素鈣注射液、雙環醇片等藥物進行治療。平時患者應控制鈉和水的攝入量，多吃新鮮的蔬菜和水果，能夠補充維生素。
2.肝癌：其是指肝臟的惡性腫瘤，可引起連續三年體檢發現甲胎蛋白升高的情況，患者可有腹痛、腹部腫塊、黃疸、消瘦等表現。建議患者遵醫囑采用腹腔鏡肝腫瘤局部切除術、肝癌經皮肝穿刺射頻熱凝術等手術進行治療，術后配合化療、放療等方式進行治療。平時患者注意休息，不宜進行重體力活動及高強度體育鍛煉，適當進行康復訓練。
此外，肺癌、胰腺癌等原因也可引起上述癥狀，建議患者及時就醫，明確診斷后對癥治療。