頭孢丙烯干混懸劑和頭孢克肟的區別主要表現在抗菌譜、臨床應用，以及腎毒性等方面。頭孢丙烯干混懸劑的有效成分是頭孢丙烯，是第二代頭孢菌素類抗生素，頭孢克肟是第三代頭孢菌素類抗生素。
1、抗菌譜：頭孢丙烯對革蘭氏陽性菌作用明顯，但僅對少數革蘭氏陰性菌有作用，對厭氧菌也有一定作用，但對銅綠假單胞菌無效。頭孢克肟對革蘭氏陰性菌作用強，對于革蘭氏陽性菌比頭孢丙烯差，能有效控制嚴重的銅綠假單胞菌感染。頭孢丙烯的抗菌譜相對較廣，主要包括金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、化膿性鏈球菌、李斯特菌、表皮葡萄球菌，以及草綠色鏈球菌、革蘭氏陽性菌，以及部分革蘭氏陰性菌，如流感桿菌、卡他莫拉菌，以及枸櫞酸桿菌、大腸桿菌等。頭孢克肟對以下的菌種有明顯的抗菌活性，如流感桿菌、肺炎球菌、大腸桿菌等；
2、臨床應用：頭孢丙烯主要用于急性咽炎、急性扁桃體炎、中耳炎、急性鼻竇炎、急性支氣管炎和慢性支氣管炎急性發作，除此之外，還包括單純性皮膚及軟組織感染。頭孢克肟主要用于敏感菌所致的慢性支氣管炎的急性發作，以及急性支氣管炎并發細菌感染、支氣管擴張合并感染、肺炎、腎盂腎炎，以及膀胱炎、膽囊炎、猩紅熱、中耳炎，以及淋病奈瑟菌導致的尿道炎；
3、腎毒性：第二代頭孢菌素如頭孢丙烯，可損害近曲小管細胞而出現腎毒性，第三代頭孢菌素如頭孢克肟對腎臟基本無毒。
由于頭孢丙烯干混懸劑和頭孢克肟都屬于頭孢類抗生素，二者抗菌譜其實有一定交叉，在部分菌種感染上可以通用，在用藥之前都需要做皮試，避免出現輸液過敏的現象。同時在使用這兩種藥物期間禁止飲酒，避免更嚴重的情況發生。