不建議切除蛛網膜囊腫的原因一般是手術可能會傷及周圍正常組織。
蛛網膜囊腫是成人發育期蛛網膜分裂異常造成的，屬于先天性疾病，囊壁為腦膜上皮細胞，囊腫與腦室或蛛網膜下腔不通，可以是單囊，也可以是多囊。常見的表現是顱內壓增高，癥狀為頭痛、惡心、嘔吐、精神減弱、癲癇等。通常不建議切除蛛網膜囊腫，因為部分囊腫可能是無癥狀且良性的，并沒有引起顱內壓增高，進行手術可能會傷及周圍正常組織，例如在切除囊壁時，可能因撕扯導致局部出血或囊腫內囊液流出，引起無菌性腦炎，導致并發癥的出現。
醫生需要綜合考慮患者的癥狀和囊腫的特征來決定最佳的治療方式，其手術指征一般是有明確引起顱內壓增高表現、合并囊內出血者、有明確為蛛網膜囊腫所致的局灶性神經功能缺失，以及合并癲癇，癲癇癥狀嚴重且反復發作，藥物控制無效，或者是囊腫有增大趨勢，腦電圖和顱內壓有變化者。手術治療主要包括囊腫抽吸和鉆孔引流、內鏡手術、囊腫分流手術、開顱手術等。
治療期間患者要注意休息，保證充足的睡眠，規律飲食。