導致肛門發黑癢的原因較多，常見有肛周濕疹、痔瘡、尖銳濕疣、肛瘺、肛門皮膚真菌感染等，需要及時就醫以明確病因，并根據具體的原因選擇適合的方法進行治療。
1、肛周濕疹：是發生在肛門周圍皮膚的過敏性非傳染性疾病，患者自覺局部皮膚奇癢難忍，而且伴有潮濕癥狀，檢查時可以發現局部有丘疹、丘皰疹，基底潮紅，病程較久還有可能發生色素沉著，使得局部皮膚變黑，即可出現肛門發黑癢的現象。建議局部使用硼酸溶液濕敷，還可以考慮涂擦爐甘石洗劑，如果以上方法無緩解，還可使用抗組胺藥物進行治療，比如鹽酸西替利嗪、氯雷他定等；
2、痔瘡：痔瘡發生嵌頓之后，如果沒有及時治療，痔塊會發生缺血、壞死，醫學上稱為絞窄性痔，肛門痔塊顏色發黑，還會出現肛周瘙癢癥狀，也可出現肛門發黑癢的現象。需要急診通過痔切除術將絞窄的痔塊切除，術后還需要定期消毒換藥，以改善不適；
3、尖銳濕疣：是由于人乳頭瘤病毒感染而導致的性傳播疾病，患者肛門處可以觸及疣狀腫物，腫物增大到一定程度，還有可能破潰、滲出，引起明顯潮濕、瘙癢癥狀，局部皮膚色素沉著時，顏色加深變黑，也可出現肛門發黑癢的現象。如果疣體較小，可以考慮藥物治療，比如局部應用咪喹莫特乳膏。如果疣體較大，建議行激光、冷凍、高頻電刀燒灼或者手術切除疣體等；
4、肛瘺：瘺管位于肛門直腸周圍，瘺外口位于肛門附近皮膚，會間斷或者持續排出分泌物，刺激肛門口皮膚出現瘙癢癥狀。如果不注意飲食或者身體抵抗力低下時，局部還有可能反復腫痛。若長期沒有得到有效治療，感染反復發作，就會導致局部皮膚色素沉著，顏色變黑。建議盡早通過手術治療，將瘺管切開或者切除，并開放傷口引流；
5、肛門皮膚真菌感染：檢查時可以發現肛門附近皮膚有環狀或者半環狀的斑片，伴有丘疹、水皰以及瘙癢癥狀。反復抓撓、摩擦。會導致局部皮膚破損滲出，使得瘙癢癥狀更加明顯，還容易導致局部皮膚色素沉著、變黑。建議遵醫囑使用抗真菌藥物進行治療，比如外用鹽酸特比萘芬乳膏、內服伊曲康唑膠囊等。