氣管鏡和肺穿刺都是用于診斷肺部疾病的重要檢查手段，二者在操作過程中都會給患者帶來一定程度的不適，但兩者的痛苦程度因個體差異和具體情況而異。
氣管鏡檢查是將一根細長的支氣管鏡通過口腔或鼻腔插入氣管和支氣管，以直接觀察呼吸道內部的情況。在檢查過程中，患者可能會感到一些不適，主要包括以下方面。一是咽喉部的刺激感，當氣管鏡通過咽喉時，會引起惡心、嘔吐、咳嗽等反應，部分患者可能感覺比較強烈。二是氣道內的感覺，氣管鏡在氣道內移動和檢查時，可能會導致氣道痙攣，引起胸悶、氣短等不適，尤其是對于氣道敏感性較高的患者。然而，在檢查前，醫生通常會對患者進行局部麻醉，以減輕這些不適癥狀。大多數患者在經過適當的準備和配合后，能夠較好地耐受氣管鏡檢查。
肺穿刺是在影像學引導下，用穿刺針經皮穿刺進入肺部病變組織，獲取組織樣本進行病理檢查。肺穿刺的痛苦主要來源于以下幾點。一是穿刺部位的疼痛，雖然在穿刺前會進行局部麻醉，但在麻醉藥效過后，患者可能會感到穿刺部位有一定的疼痛。二是心理壓力，由于肺穿刺是一種有創操作，患者可能會對其產生恐懼和緊張心理，這種心理因素也會在一定程度上增加患者的不適感。三是潛在的并發癥風險，如氣胸、出血等，雖然發生率相對較低，但一旦發生，可能會導致胸痛、呼吸困難等癥狀，增加患者的痛苦。
總體來說，無法簡單地比較氣管鏡和肺穿刺哪個更痛苦。有些患者可能對氣管鏡檢查的咽喉部刺激反應更為敏感，而覺得氣管鏡更痛苦；而有些患者則可能因為擔心肺穿刺的并發癥等原因，覺得肺穿刺更難以忍受。
在選擇檢查方法時，醫生會根據患者的具體病情、病變部位、身體狀況等因素綜合考慮，權衡利弊，選擇最適合的檢查手段。無論進行哪種檢查，患者都應積極配合醫生，在檢查前充分了解相關注意事項和可能的風險，以減少不適和并發癥的發生。
如果需要進行氣管鏡或肺穿刺檢查，患者應與醫生充分溝通，了解檢查的目的、過程和可能的不適及風險。在檢查前，要按照醫生的要求做好準備工作，如禁食、禁水等。檢查過程中，要盡量放松，配合醫生的操作。檢查后，如果出現不適癥狀，如咳嗽加劇、胸痛、發熱、咯血等，應及時告知醫生，以便醫生進行及時的處理。