HPV16陽性二級病變一般能治好，對于早期發現和積極干預能有效控制病情進展。
HPV16陽性是一種高風險的HPV感染，長時間的感染可能會引發宮頸癌，因此需要進行抗HPV病毒的治療以清除體內的病毒。對于已經有宮頸病變的患者應定期到醫院行細胞學檢查，以確定是否患有宮頸癌或可能患其他疾病。HPV16陽性二級病變通常指的是宮頸癌前病變的二級，如果不進行及時的治療，有可能進一步發展為癌前病變的三級，甚至可能發展為宮頸浸潤癌。有必要實施抗HPV療法和手術療法等。
在治療期間，應避免性生活，以防止交叉感染。術后需要定期復查HPV和TCT，以監測病情變化。注意充足的休息，營養均衡，適當運動等，以提高身體抵抗力，有助于病毒消退。