卵圓孔未閉及房間隔缺損治療以經導管封堵術為主，外科手術為輔。
手術要在重度肺動脈高壓發生前選擇適當時間進行。一般手術或者介入治療時機，應選20歲前最佳。經導管封堵術及胸外科術后遠期會出現房性心律失常，其中心房撲動及心房顫動最多。對喪失手術機會發生心力衰竭者，可按抗心衰藥物處理，其預后極差。出現卵圓孔和房間隔缺損患者應該盡早前往醫院，在專業醫生的指導下進行治療。