通常情況下，手掌小指側根部掌邊疼可能是外傷、腱鞘炎、韌帶損傷等原因引起的，需及時就醫進行治療。具體分析如下：
1.外傷：如果患者手掌受到撞擊、打壓等，局部疼痛，可能是外傷引起的，通常建議及時在醫生的指導下使用云南白藥氣霧劑、活血止痛散等藥物進行治療。
2.腱鞘炎：如果患者長期從事重體力勞動、打字等，就可能會導致手的局部肌肉勞損，被病原體感染后，就可能會出現腱鞘炎，從而導致局部疼痛。一般建議遵醫囑使用吡羅昔康貼片、氟比洛芬凝膠貼膏等藥物進行治療。
3.韌帶損傷：如果患者的手掌突然被牽拉，出現疼痛的情況，可能是局部韌帶損傷引起的，建議及時在醫生的指導下采取制動，還要使用復方水楊酸甲酯乳膏、傷痛酊等藥物進行治療。
除此之外，還可能是骨折引起的上述癥狀，建議及時就醫進行檢查，對癥治療。