甲狀腺囊腺瘤通常不會自愈。
甲狀腺囊腺瘤指甲狀腺細胞出現了異常的增生，一般是單發的結節，位于甲狀腺的一側，不處理可能會長期存在，通常不會自愈，即不會自行消失。但是因為該疾病多數屬于良性病變，可進行保守治療。如果體積比較小，且沒有造成患者身體不適，通常不需要處理，定期觀察即可。如果引起了甲狀腺功能亢進癥類似的癥狀，如肌肉無力、多汗、易激動、失眠等，可遵醫囑使用抗甲狀腺藥物治療，如丙硫氧嘧啶片、甲巰咪唑片等。如果壓迫到患者的頸部，必要時也可以通過手術切除病變。
治療期間要保持心情愉悅，保證充足的睡眠，避免過度勞累。