很多存在特殊疾病的患者不敢吃藥，而慢性腎炎患者感冒后可以服用絕大多數的感冒藥，但具體的藥物需要根據個人臨床癥狀決定。一般不建議服用氨基糖苷類抗生素，如硫酸慶大霉素、妥布霉素、阿米卡星等。
因氨基糖苷類抗生素具有一定的腎毒性，慢性腎炎患者服用后會直接損傷腎小管上皮細胞，可能導致急性腎小管壞死，加重慢性腎炎的病情。因此出于安全考慮，不建議服用氨基糖苷類抗生素。當慢性腎炎患者感冒后，多數中成藥或者西藥都是可以服用的，如感冒清熱顆粒、金花清感顆粒、連花清瘟膠囊等中成藥。如果懷疑病毒感染，則可以應用奧司他韋；如果懷疑有細菌感染，可以用青霉素類或者頭孢哌酮等藥物進行抗感染治療；如果患者出現發熱，則可以應用洛索洛芬鈉、布洛芬等藥物降溫，它們對于慢性腎炎患者并沒有明確的負面影響。
慢性腎炎患者如果在感冒時應用阿莫西林等藥物，需要盡量注意多喝水，多補充體液，特別是大量出汗的患者，避免或者預防急性腎損傷的發生。因阿莫西林可以在尿中形成晶體，晶體結合在一起可能會堵塞腎小管，導致患者出現急性腎小管壞死，對于患者的治療也不利。