漱口水一般有一定的殺菌作用。
漱口水具有清潔口腔、減少牙垢、抑制細菌、使口氣清新以及減少齲齒和治療牙周病、口干癥、口腔黏膜病等口腔疾病的功效與作用；漱口水一般的成分是香味劑、乙醇、表面活性劑、防腐劑等，乙醇和表面活性劑有殺菌和清潔的作用，能夠一定程度消滅口腔內的有害菌。
漱口水漱口不僅能防止口臭，使口腔清潔舒適，還能將飯后附著在牙齒表面尚未被細菌發酵的食物殘渣沖掉，減少牙病發生的機會；正確的漱口方法是將漱口水含在嘴里，緊閉嘴唇，上下牙稍微分開，鼓動唇頰部的肌肉，使漱口水充分接觸牙面、牙齦及黏膜表面，并通過舌的運動，使漱口水來回通過牙縫，達到漱口的作用；常用的漱口水有清潔水、鹽水、藥物漱口水等，可根據自身口腔情況進行選用。
注意漱口不能代替刷牙，含有藥物的漱口水雖然能抑制細菌生長，但不能替代牙刷對菌斑的機械性清除作用，只能作為刷牙之外的輔助手段使用。