智齒并非都必須拔除，也有可以保留的智齒，但對于需要拔除的智齒，如果不拔會也產生較多危害。通常牙醫都建議將智齒拔掉是因為智齒有反復炎癥、影響鄰牙、無對頜牙等問題，因此需要將其拔除。
1、反復炎癥：由于智齒萌出不全，其后側的牙齦覆蓋部分牙冠形成冠周袋，積存食物和細菌，可造成局部軟組織經常發炎，疼痛難忍，甚至導致開口受限而影響進食。部分人使用消炎藥物之后疼痛暫時得到緩解，可以進食之后便不愿拔除，結果再次發炎，癥狀會愈加嚴重；
2、影響鄰牙：大多數智齒前傾阻生，即呈45°左右角頂在第二磨牙上，兩個牙冠形成一個夾角而嵌塞食物，長期如此，第二磨牙形成齲壞直至發展成牙髓炎，另一個后果是前傾的智齒持續加力于第二磨牙，使其形成牙周炎，進而疼痛松動，不得不拔除第二磨牙，或須拔除這兩顆牙，使咀嚼功能嚴重受損。有的智齒雖然萌出方向大致正常，但與第二磨牙的接觸點不正常，經常嵌塞食物，并且刷牙時不易刷到此處牙間隙，極易造成第二磨牙齲壞而縮短其使用壽命；
3、無對頜牙：如果該智齒無對頜牙，使其在咀嚼時經常損傷對頜處的軟組織，可考慮將智齒拔除。