兩邊腮幫子腫了還流酸水可能是非疾病因素引起，如飲食不當、精神緊張，也可能是腮腺炎、口腔潰瘍、牙周炎、頜下淋巴結腫大等疾病因素導致，建議在醫生指導下進行針對性治療。
一、非疾病因素：1、飲食不當：如果長時間進食較堅硬的食物，如檳榔等，會導致局部肌肉長時間過于緊張，刺激局部分泌腺、血管、肌肉等組織，致使唾液分泌增多，以及出現腫脹、疼痛等癥狀，還可能是進食較酸、過甜的食物，或是機體過于饑餓等因素致使胃酸分泌過多，出現流酸水的情況，可通過調整飲食習慣改善，以松軟的食物為主。
2、精神緊張：如果近期工作、學習壓力較大，長時間處于精神緊張的狀態下會導致機體消耗的能量較多，當胃腸的食物不夠消化，此時胃酸分泌較多會出現反酸的情況，可通過疏通緊張的情緒緩解。
二、疾病因素：1、腮腺炎：可能是感染、免疫、腮腺管阻塞等因素所致，當腮腺及其導管因被細菌感染時，腮腺出現炎癥反應，炎性因子刺激腮腺，致使腺體充血、水腫、滲出、腮腺管擴張等，可使用復方頭孢克洛膠囊、阿莫西林膠囊等藥物治療。
2、口腔潰瘍：可能是局部機械刺激或物理、化學刺激、病原菌感染、微量元素缺乏等因素，導致口腔黏膜出現局部性缺損，若不及時治療，病情逐漸加重，口腔黏膜可出現糜爛、潰瘍，黏膜發紅、水腫、滲出，可使用復方氯己定含漱液、西地碘片等藥物治療。
3、牙周炎：通常是創傷、不良生活習慣等因素導致牙菌斑生物膜形成和堆積，導致牙周組織出現慢性炎癥，致使局部血液循環阻滯，局部血管擴張、組織水腫、血管增生、充血，可使用鹽酸米諾環素軟膏等藥物治療，還可使用牙周翻瓣手術、骨修復等手術治療。
4、頜下淋巴結腫大：可能是感染、腫瘤、藥物等因素導致出現頜下淋巴結炎癥反應，炎性因子刺激淋巴結，致使淋巴結出現腫脹、疼痛等癥狀，可使用羅紅霉素顆粒、復方頭孢克洛片等藥物治療。
除以上因素，還可能與胃食管反流有關，建議去醫院口腔科就診，通過血常規、視診、組織病理學檢查等相關檢查明確病情，積極配合醫生治療。