驗孕紙顯示陽性通常表明可能懷孕，但具體是否為宮內妊娠還需進一步檢查。
您提到已經三個月未來月經，并且使用了晨起第一次尿液檢測，這增加了結果的準確性。然而，超聲和血液檢查未發現子宮內的妊娠囊，這提示可能存在以下幾種情況：
早期流產：可能在受精后胚胎未能正常發育，導致自然流產。
宮外孕：雖然血液中的hCG水平升高，但超聲未顯示宮內妊娠，這種情況需要特別警惕。
激素異常：某些情況下，體內激素水平的變化可能導致驗孕紙出現假陽性反應。
醫生建議使用黃體酮和口服避孕藥可能是因為需要調節您的內分泌狀態，同時觀察身體變化。如果持續出現子宮疼痛或其他不適癥狀，請及時就醫進行詳細檢查，以明確病因并接受針對性治療。
總之，面對驗孕結果與超聲檢查不一致的情況，保持警惕并積極配合醫生的建議是非常重要的。如果有任何疑問或癥狀加重，請立即尋求專業醫療幫助。