日常所見的甘油脂肪酸酯多用于食品添加劑中，屬于脂質的一種，對身體是否有害不能一概而論，一般少量進食沒有較大影響。但如果過量進食，尤其是長期進食，可能對身體有害。
甘油脂肪酸酯能產生的危害不能一概而論，還需要結合整體情況進行判定。甘油脂肪酸酯是一種不飽和脂肪酸，多用于餅干、蛋糕、面包等食品的生產中，這類食品脂肪含量較高，少量進食可能并沒有太大的影響。但如果大量進食這類食物之后，容易出現黃色瘤、動脈粥樣硬化、肥胖等，可能對身體健康不利，但這種危害并非甘油脂肪酸酯單一作用的結果。
日常正常飲食中，攝入這種成分超標的可能性較小，一般不會對身體產生危害，所以不必過于擔心。在選購含有甘油脂肪酸酯成分的食品時，需要選擇正規廠家生產的，以免食品添加劑使用不合格或生產不衛生，對人體產生危害。