新生兒心臟缺口可能正常，也可能是不正常的，需要通過進一步的檢查來明確診斷。
新生兒心臟發育不全，可能會出現心臟有缺口的癥狀，若新生兒沒有其他不適癥狀，一般是正常的，隨著自身的生長發育，心臟會逐漸發育完全，缺口也會逐漸消失。但是新生兒出現上述情況后，偶爾會出現呼吸困難、心悸、氣喘、口唇青紫等異常癥狀，通常是不正常的，考慮是先天性心臟病引起的。此時需要及早就醫，完善體格檢查、心電圖、X線檢查、超聲心動圖等檢查來明確診斷。若確診為先天性心臟病，需要在醫生的指導下選擇先天性心臟病糾治術、雙向格林手術、介入治療等方式來控制病情。
平時家長應悉心照顧新生兒，喂養比較困難時，可用滴管滴入，喂奶后輕輕放下，并使新生兒保持側臥姿勢，以防嘔吐物吸入而引起窒息。