糠酸氟替卡松和糠酸莫米松，兩者都屬于鼻用激素類噴劑，主要用于治療過敏性鼻炎，兩者在藥物的特性上有一些區別，主要體現在水溶性和脂溶性，因此藥物的持續時間、鼻黏膜親和力有所不同，此外適用年齡也有所不同。
1、水溶性：糠酸氟替卡松的水溶性小于糠酸莫米松，而水溶性是決定藥物在鼻腔黏膜持續的時間，水溶性越大，藥物在鼻腔黏膜停留的時間越長，因此發揮作用的時效會越長，所以糠酸莫米松的效能或者持續時間會更長一點；
2、脂溶性：糠酸氟替卡松的脂溶性比糠酸莫米松大，而脂溶性決定了藥物在鼻黏膜的親和力，脂溶性越大在局部的親和力越大，在局部發揮作用的時間越短，糠酸氟替卡松副作用相對來說大一點；
3、適用年齡：糠酸莫米松適用于三歲以上的小孩，而糠酸氟替卡松適用于四歲以上的小孩。對于年齡比較小的小孩，應用糠酸莫米松鼻噴霧劑相對來說更安全一點。
在臨床上，兩者的藥物效果沒有本質區別，但因個人體質可能療效會有一定差異。如果是過敏性鼻炎的患者，可以分別用這兩種藥去嘗試一下，明確對哪一個藥的效果更敏感或者效果更好。