在殺神經過程中，不同的治療、治療步驟會有不同的疼痛反應。殺神經的疼痛級別大概處于1-2級，個別情況下，例如麻醉無效、冷熱刺激誘發神經痛等，也有可能會達到3級的程度。
目前疼痛分級分為5級，分別為0、1、2、3、4級。0級為沒有疼痛，1級是輕度疼痛，2級是中等程度疼痛，3-4級即為重度疼痛。殺神經的過程中，由于采取局部麻醉的方式，部分患者會達到1級，即有輕度不適。在進行根管預備后，有時會有根備反應，此時可能發生2級疼痛，疼痛比較劇烈，但是服藥可以控制。另外，根據牙齒的狀態不同，可能術后反應并不同，部分根尖周炎患者治療完成以后，或者治療過程中，可能會出現較大的根管預備、根充反應，有可能達到2級，個別患者對疼痛敏感，甚至達到3級，對此建議術后服用消炎藥和止疼藥進行控制，常用甲硝唑片、布洛芬片等。
進行殺神經治療前，通常會對患者牙齒的狀態，以及年齡、機體抵抗力等進行充分的評估，術后可能會發生脹痛反應，此為正?，F象，必要時可在醫生指導下應用替硝唑膠囊等藥物進行抗炎處理即可。