核磁共振成像一般能檢查出存在器質(zhì)性病變的腸道疾病，但是對(duì)于非器質(zhì)性病變的腸道疾病，可能無(wú)法查出。
核磁共振成像據(jù)所釋放的能量在物質(zhì)內(nèi)部不同結(jié)構(gòu)環(huán)境中不同的衰減，通過外加梯度磁場(chǎng)檢測(cè)所發(fā)射出的電磁波，即可得知構(gòu)成這一物體原子核的位置和種類，據(jù)此可以繪制成物體內(nèi)部的結(jié)構(gòu)圖像，能夠?qū)δX部、甲狀腺、肝、膽、脾、腎、胰、子宮、卵巢、前列腺等實(shí)質(zhì)器官進(jìn)行診斷。如果腸道存在異常，能夠有助于明確腸道是否存在息肉、腫瘤等異常病灶，從而輔助診斷腸息肉、大腸癌、結(jié)腸癌等疾病，但是對(duì)于非器質(zhì)性病變的腸道疾病，包括腸道菌群失調(diào)癥、慢性腸炎等疾病，通過核磁共振成像通常難以診斷。