三個月嬰兒腸絞痛是可能是消化不良引起的，也可能是胃腸炎導致，不同病因其治療方法不同，建議前往醫院，明確病因，對癥治療，具體如下：
1、消化不良：多是由于嬰兒牛奶蛋白過敏或者媽媽飲食導致的。多表現為腹脹、腹瀉、嘔吐和哭鬧等癥狀。可以去醫院檢驗一下嬰兒糞便里是否帶有細菌。媽媽要注意要調節飲食。可以在醫生的指導下通過服用腸道益生菌類的藥物進行調節。
2、胃腸炎：是一種胃腸道黏膜的急性炎癥，通常是接觸被病原微生物污染的食物或水所致。物或水所導致。常表現為惡心、嘔吐、腹瀉、發熱、寒戰、頭痛等，可能伴有黏膜干燥、心動過速、皮膚彈性差、皮膚變暗、黑眼圈、玻璃狀眼睛等癥狀。需根據患者自身情況，在醫生的指導下通過慶大霉素、東莨菪堿、多潘立酮、莫沙必利等藥物進行治療。
可以適當給嬰兒腹部進行熱敷，按摩肚臍緩解不適感。嬰兒如果是母乳喂養媽媽平時要注意飲食清淡，多飲水，禁忌辛辣、油膩、生冷等刺激性食物，例如辣椒、大蒜、可樂、咖啡等食物。家長可以多食用一些新鮮的蔬菜水果和有營養的食物，例如牛奶、蘋果、香蕉、生菜等食物。家長要保持居住環境的清潔衛生，要勤通風，以保持空氣的清新度。平時要注意嬰兒的護理,做好嬰兒的腹部的保暖工作,以免腹部受涼。可以讓嬰兒進行適當運動，加強鍛煉，增強身體抵抗力。家長要注意嬰兒平時的個人衛生，每天都應該給嬰兒進行局部的清洗。盡量給嬰兒營造一個健康、干凈的生長環境，減少嬰兒患病的幾率。