胚胎停止發(fā)育藥流一般情況下能流干凈，但根據患者的體質不同，恢復情況也不一樣，也有可能不能流干凈。具體分析如下：
1、能流干凈：胚胎停止發(fā)育屬于胚胎發(fā)育不良的現象，可能是染色體異常、免疫因素、自身因素等多方面的原因引起，胚胎停止發(fā)育藥流后大多都能流干凈，胚胎停止發(fā)育一般在孕初期，此時孕囊比較小，服用藥物之后能夠加強子宮收縮，將胚胎的組織完全排除干凈，同時也不需要進行清宮手術。
2、可能不能流干凈：為了停止發(fā)育藥物流產也可能不能流干凈，需要根據患者的體質來進行判斷，如果患者體質虛弱，在恢復期間引起胚胎粘連、宮縮不良等原因，可能會導致藥物不能完全流干凈。宮腔內還會殘留胚胎組織，需要及時采取清宮手術或人工流產等方式來進行治療。