化橘紅并沒有六大危害這個說法，副作用也沒有明確，一般人適量服用，或對癥患者按醫囑服用，通常不會產生明顯危的害?；偌t性質溫和，但因每個人體質不同，如果服用不對癥，可能會有一些危害。
若有嗜睡、納差氣虛等表現者服用化橘紅，或者口干、失眠多夢、月經不調、潮熱盜汗、咳黃色粘稠樣痰液的陰虛表現者服用化橘紅，可能會使相應癥狀進一步加重。一般人群平時也不宜多食，以免增加身體負擔，且因其性質偏溫，若天氣較熱時大量服用，往往會導致口咽干燥，適宜在天氣寒冷時適量服用。
化橘紅主要的入藥部位為植物未成熟或快成熟的干燥果皮，其味辛、苦，性溫，歸肺、脾經，可以止咳平喘、解酒、消食、燥濕化痰，主要用于治療咳嗽痰多、食積傷酒。此外，化橘紅還有健脾祛濕的功效，濕氣較重者，表現如頭昏頭重、食欲不振、大便溏瀉、舌苔厚膩等，可以適當服用一些化橘紅，用以祛濕。運用該藥時，應在醫師指導下進行，不能擅自用藥。