一般情況下，指甲里面變黃了還疼可能是外力因素、甲癬等原因導致的，建議患者根據實際情況選擇合適的方法來處理。具體分析如下：
1.外力因素：通常情況下，指甲受到重物的擠壓、碰撞或者長時間接觸化學物質都可能出現指甲里面變黃了還疼的癥狀，可以用指甲銼適當對甲面進行打磨，使用碘酒涂抹甲面，促進指甲自然生長恢復，改善情況，一般不需要特殊治療。
2.甲癬：甲癬是常見的指甲部真菌感染疾病，通常由紅色毛癬菌、須癬毛癬菌、絮狀表皮癬菌等真菌引起，有指甲表面凹凸不平、顏色暗淡、發黃發灰、按壓疼痛等癥狀?；颊呖梢詫⒆凕S的指甲刮薄，在甲面涂抹碘酒或冰醋酸溶液，或將指甲浸泡在碘酒中，改善指甲變黃的情況。也可以在醫生的指導下涂抹藥物，如酮康唑乳膏、鹽酸特比萘芬乳膏、環吡酮胺乳膏等，能夠有效改善甲癬的癥狀。
患者平時也應保持良好的衛生習慣，勤剪指甲，保持局部的干凈衛生。