手足口疫苗是指EV71型手足口病疫苗，通常需要接種兩針，兩針間隔1個月，全部接種后不需要再次接種。若兒童沒有接種過，家長可以帶兒童進行接種。
EV71型手足口病疫苗要打兩針，自兒童6月齡起開始接種首針，第二針應與首針間隔1個月以上，可以使機體產生更多抗體，達到理想的免疫效果。通常鼓勵兒童在12月齡前完成全部接種，12月齡以上越早接種越好，對于5歲以上兒童，不推薦接種。
若兒童已經患過手足口病，且已經明確診斷為由EV71型感染引起的手足口病，可以不再接種EV71型手足口病疫苗，否則仍需要接種EV71型手足口病疫苗。EV71型手足口病疫苗主要用于預防EV71型感染所致的手足口病，但是不能預防其他腸道病毒感染所致的手足口病，比如柯薩奇病毒A組16型，所以兒童平時還需要做好防護。
兒童注射疫苗后應在現場觀察至少30分鐘，以便出現不良反應或過敏反應時，可以立刻治療。若兒童已經接種EV71型手足口病疫苗，與注射人免疫球蛋白應至少間隔1個月。