月經第5天子宮內膜5mm，一般屬于正常狀態，因為月經來臨期間子宮內膜會自然脫落變薄。不同時間進行檢查，子宮內膜的厚度會發生改變。
子宮內膜的厚度變化，主要與女性自身的性激素變化有直接關系，尤其是雌激素對子宮內膜的影響比較大。一般月經來的前幾天子宮內膜特別厚，能夠達到10mm左右，但是隨著體內孕激素下降，子宮內膜會自然脫落變薄，厚度為5-6mm，等月經剛干凈后子宮內膜最薄。月經干凈后，隨著時間推移，子宮內膜在雌激素作用下，會再次修復增厚，等到達排卵期后，子宮內膜厚度在7-9mm。排卵之后在孕激素作用下子宮內膜會繼續增厚，直到下次月經前子宮內膜最厚。總之，子宮內膜的厚度，會伴隨月經周期，而呈現周期性改變。
如果沒有特殊情況，不推薦在女性在月經來臨期間做子宮內膜檢測，否則可能會影響檢查結果，從而不能準確判斷子宮內膜厚度。懷疑有子宮內膜病變的女性，或者月經出現問題的女性，也可以通過月經期間進行子宮內膜診刮手術，然后安排病理檢查，判斷子宮內膜是否有異常病變。