通常蜂膠有副作用，尤其是在不恰當使用的情況下。
蜂膠是蜜蜂從植物芽孢或樹干上采集的樹脂，混入蜜蜂口器中腺體的分泌物，再和花粉、蜂蠟加工制成的一種具有芳香氣味的膠狀固體物，含有黃酮類、萜烯類等多種營養成分，有一定的抗菌消炎、增強免疫力等功效。不過，蜂膠中的成分復雜，部分人可能會對蜂膠過敏，出現皮膚瘙癢、紅腫、呼吸困難等過敏反應。而且蜂膠含有重金屬成分，如鉛、汞等，長期大量服用可能會導致重金屬在體內蓄積，對人體的神經系統、肝臟、腎臟等器官造成損害。
在使用蜂膠時，要注意選擇正規的產品。如果是初次使用，先少量嘗試，觀察是否有過敏反應。同時，不能將蜂膠當作萬能的保健品過度依賴。若使用蜂膠后出現過敏癥狀或身體不適，如惡心、嘔吐、頭暈等，應及時就醫，遵循醫生的建議進行治療，切不可自行處理，以免延誤病情。