透明隔囊腫3cm算是比較大的囊腫，患者應盡早去醫院神經外科進行手術切除。
透明隔在側腦室之間，兩側之間有狹窄的腔隙，透明隔腔的上方為胼胝體，下方為穹隆。透明隔囊腫是指側腦室間兩層透明隔之間積液過多，導致透明隔間隔擴大，從而形成的囊腫，是先天性的發育異常的一種表現。
在臨床上，較小的透明隔囊腫一般不會對人體產生太大的危害，通常不會出現明顯的特異性癥狀。但是，隨著囊腫的增大，可能會出現壓迫癥狀，從而會影響正常的血液循環。若囊腫壓迫室間孔，容易導致梗阻性腦積水，還可能會導致顱內壓增高，可伴有腦積水的相關癥狀。
在臨床上，透明隔囊腫超過1cm就算大，因此3cm透明隔囊腫屬于比較大的囊腫?；颊邞M早進行手術治療，若患者未能及時進行治療，可能會延誤病情，可能會嚴重影響正常的生活，甚至會危及生命。
建議患者盡早去醫院神經外科完善CT、磁共振等檢查，明確具體的情況，必要時需要在醫生的指導下進行手術切除，術后應注意個人護理，進一步促進病情的恢復。