乳蛋白過敏的嬰兒可能2-5年能好，由于每個嬰兒的身體情況不同，病情的嚴重程度也不同，因此疾病的恢復時間也會有所不同，具體時間因人而異。同時，部分嬰兒也可能會出現終生不好的情況。
如果嬰兒的家族人群中有乳蛋白過敏史，受遺傳影響，導致嬰兒出現乳蛋白過敏的幾率較高。同時，嬰兒出現乳蛋白過敏還與年齡較小有一定的關系，由于嬰兒年齡較小，胃腸功能發育不是特別完善，消化功能較弱，在吃乳蛋白食物時可能會出現過敏情況。如果嬰兒是由年齡較小而引起的乳蛋白過敏，而且病情較輕，只是出現輕微的皮膚瘙癢等情況，可能在2年后待嬰兒胃腸功能發育完善后，乳蛋白過敏情況會好轉。但如果嬰兒是由家族遺傳所引起的乳蛋白過敏，而且自身體質較差，出現的過敏反應較強，則可能恢復的時間相對較長，可能需要5年左右才會好。此外，部分嬰兒受遺傳因素影響較明顯，對乳蛋白過敏較嚴重，為中重度過敏，則有可能終生都不能好。
乳蛋白過敏的嬰兒在日常生活中應盡量避免吃奶制品，如牛奶、奶粉、酸奶等。如果出現急性過敏發作，還可在醫生指導下服用藥物進行治療，如氯雷他定糖漿、孟魯司特鈉咀嚼片等藥物進行治療。