大量食用桃仁有毒，少量食用桃仁則無毒。桃仁中含有一種叫苦杏仁苷的特殊成分，苦杏仁苷自身無毒，但可以被苦杏仁酶等葡萄糖苷酶水解成杏仁氰，該物質不穩定，遇熱易生成苯甲醛和氫氰酸，而氫氰酸有劇毒。如果大量口服桃仁，導致苦杏仁苷過量易引發中毒，出現頭暈、惡心嘔吐、心跳加速、血壓下降等癥狀。因此，大量食用桃仁有毒。但經炮制后的桃仁，會殺滅苦杏仁酶，保留苦杏仁苷，此時毒性會明顯下降，少量食用桃仁無毒。
而且桃仁是一味中藥，適量使用具有活血祛瘀、潤腸通便、止咳平喘的作用，常用于治療瘀血阻滯導致的經閉、痛經、腹部腫塊，以及腸燥便秘、咳嗽氣喘等癥狀。因此，臨床上不宜自行使用桃仁，應在醫生指導下使用，以免導致機體中毒。由于桃仁的上述功效，對于孕婦和便溏的患者，也應該慎用桃仁，以免引起不良后果。